《扑通扑通花少年》的故事围绕高瀚宇饰演的花千肉展开，这位美少年天生身带异香，并将自己的这一特质融入祖传绝技——蒸包子中，得到街坊邻居的疯狂追捧。然而由于在20岁之前还没有找到真爱，少年体味儿突然变淡，包子生意岌岌可危。父母赶紧安排相亲，使花千肉心烦意乱，决意离家出走。途中，他结识了任性傲娇的千金小姐白子蝎（吴桐饰）、斯文“海归”乌太贤（王修泽饰）、奇葩绑架犯一刀煞（张宁浩饰）、温柔帅气型男盐宝（蒋一铭饰）。他们喜笑怒骂，发生了一系列令人啼笑皆非的故事，而在这过程中，几人也各自找到了真爱。

17岁，前途无限的运动员大洙（姜东元 饰），有望成为偶像歌手的美娜（宋慧乔 饰），因为腹中的孩子决定成为早婚父母。大洙和美娜悉心照料患有罕见先天性早衰症的儿子雅林，他也快将17岁了，但瘦弱的身躯停留在8岁，外貌则是80岁的老人！命运并未封锁雅林青春的心灵，继承了父亲的乐观、母亲的感性，对人生有着异于常人的早熟及领悟。有日，雅林一家三口的故事被电视台广泛报导，瞬间成为公众话题，令他余下的人生得以走得更高、更远、更颠簸……